Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 LPGAT1-201ENST00000366996 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RBP4-203ENST00000371469 814 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CHCHD1-202ENST00000372837 1202 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 HNRNPA1P73-201ENST00000446472 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC008021.1-201ENST00000474180 414 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ARHGEF26-AS1-203ENST00000480639 582 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 KIAA1191-210ENST00000510164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FAM213AP2-201ENST00000521579 683 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
POLD1P28340 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD1P28340 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD1P28340 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD1P28340 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD1P28340 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD1P28340 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
POLD1P28340 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AL512328.1-203ENST00000428480 673 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DHRSX-IT1-201ENST00000437244 651 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 OR52X1P-201ENST00000446117 914 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CST7-201ENST00000480798 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AACSP1-202ENST00000521412 1095 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 FAR1-IT1-201ENST00000525233 368 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SCGB1A1-202ENST00000534397 466 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PDCD2-205ENST00000537445 1114 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC009119.3-202ENST00000566773 196 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC092296.1-201ENST00000587018 566 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC091905.3-201ENST00000624959 234 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC005609.1-201ENST00000625195 617 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CDIPT-AS1-203ENST00000638164 713 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CWC27-201ENST00000381070 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 GPR83-201ENST00000243673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 RPS6-201ENST00000315377 863 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
POLD1P28340 AL137077.1-201ENST00000442115 528 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms