Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CHD3-203ENST00000380358 7356 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 LOXHD1-203ENST00000398686 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TRAK1-210ENST00000613405 4672 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ANKRD36B-201ENST00000258459 5986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ENO2-214ENST00000545045 1911 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 EHD1-202ENST00000359393 3618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ACVR2A-201ENST00000241416 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 DGKZ-204ENST00000454345 4086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ARID4A-202ENST00000355431 5891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SDC3-201ENST00000336798 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 CDK20-202ENST00000336654 2176 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 ZNF71-201ENST00000328070 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RALGPS1-201ENST00000259351 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AP1B1-202ENST00000357586 4176 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 MRPS12-201ENST00000308018 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
HPGDP15428 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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