Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 IL18BP-206ENST00000393707 1037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 CCDC178-201ENST00000300227 3087 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 CFAP36-204ENST00000406691 1575 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 UBA2-201ENST00000246548 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 FAM122B-201ENST00000298090 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ZSCAN16-AS1-201ENST00000600652 2163 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC106707.1-201ENST00000475981 1640 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 POLR2L-201ENST00000322028 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC147651.3-201ENST00000429872 731 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 AC132812.1-201ENST00000583145 892 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 GFPT2-201ENST00000253778 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 STK25-235ENST00000543554 2556 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
HHLA1C9JL84 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 FUCA1P1-201ENST00000374476 1351 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 KCTD6-202ENST00000404589 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
HHLA1C9JL84 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms