Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TMEM78-201ENST00000323223 2175 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AC135782.3-201ENST00000562782 2105 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 GOLGA8IP-201ENST00000340249 1899 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SIGLECL1-201ENST00000316401 1708 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ACTBP14-201ENST00000411655 1089 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 EEF1GP8-201ENST00000506566 1154 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 FGD4-203ENST00000472289 1629 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SARS-201ENST00000234677 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 PKM-220ENST00000568459 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 IL27-201ENST00000356897 1044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
ODF3BA8MYP8 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms