Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 LINC02188-202ENST00000569740 3775 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZCCHC8-207ENST00000543897 5663 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 OR52A1-202ENST00000380367 9783 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GRIN1-207ENST00000371560 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TCEAL4-208ENST00000472484 1273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TXLNA-201ENST00000373609 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MYLK-202ENST00000354792 7531 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 EHMT2-204ENST00000395728 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MTA3-202ENST00000405592 5832 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SETD1B-202ENST00000542440 8185 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RAB11FIP1-206ENST00000524118 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KPNA4-201ENST00000334256 8981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SLC5A11-202ENST00000424767 2399 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 COL1A2-213ENST00000620463 4523 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 KCNMA1-287ENST00000640632 2808 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 METTL13-202ENST00000362019 3022 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PIK3R3-203ENST00000420542 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 SH3TC2-202ENST00000502274 2681 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
FANCFQ9NPI8 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms