Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SRL-202ENST00000537996 1814 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TMEM60-201ENST00000257663 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CELA3A-201ENST00000290122 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC008080.1-201ENST00000311067 1058 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 MED15P3-201ENST00000413613 326 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 FAM197Y6-201ENST00000420524 766 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 KCNK15-AS1-202ENST00000427303 528 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC010997.2-201ENST00000427610 260 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IGHV3-43-201ENST00000434710 434 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 Z82249.1-201ENST00000453866 568 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CLNK-203ENST00000507719 1143 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IMMP1L-213ENST00000533642 314 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AL121790.2-202ENST00000556024 363 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SNX11-210ENST00000582104 1282 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC002985.1-201ENST00000596918 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CSAG3-201ENST00000599845 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CSAG2-203ENST00000638741 844 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 GFI1B-202ENST00000372122 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TUBAL3-201ENST00000380419 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AL591806.3-201ENST00000289779 2096 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 C22orf42-201ENST00000382097 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 THPO-203ENST00000445696 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SLC35A2-203ENST00000376515 1044 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 IFNA2-201ENST00000380206 1135 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CACYBPP3-201ENST00000406011 625 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 HNRNPA1P25-201ENST00000422644 937 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC004895.1-202ENST00000435547 547 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 C1orf198-207ENST00000523410 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC015922.3-201ENST00000582780 347 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 MAFG-AS1-202ENST00000583492 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 AC083798.2-202ENST00000609469 553 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PLEKHG6-202ENST00000304581 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 TTC23L-203ENST00000505624 1353 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 CCDC175-201ENST00000281581 2487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SLC25A3-202ENST00000228318 1678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 ARCN1-204ENST00000534182 1669 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
SIRT1Q96EB6 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms