Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ANKRD20A19P-202ENST00000442969 2796 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ATP2B3-204ENST00000370186 6742 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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GTF3C6Q969F1 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 GDAP2-201ENST00000369442 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
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GTF3C6Q969F1 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C6Q969F1 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C6Q969F1 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C6Q969F1 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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GTF3C6Q969F1 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 WDR81-205ENST00000437219 3184 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 ZFP90-209ENST00000570495 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SDC1-202ENST00000381150 3291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 OTP-201ENST00000306422 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GTF3C6Q969F1 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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