Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ATP12A-201ENST00000218548 3732 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PRDM10-202ENST00000358825 6322 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PRDM10-203ENST00000360871 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC239799.1-201ENST00000612520 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PEAR1-201ENST00000292357 4866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NTNG1-204ENST00000370067 4628 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MAP7D2-201ENST00000379643 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SMOC2-202ENST00000356284 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ABBA01031663.1-201ENST00000635630 790 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EPHA5-203ENST00000432638 3662 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 C15orf39-207ENST00000567617 4249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 HYOU1-220ENST00000617285 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 BAK1-203ENST00000442998 2212 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TGM1-201ENST00000206765 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
CSPP1Q1MSJ5 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms