Protein–RNA interactions for Protein: Q16342

PDCD2, Programmed cell death protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD2Q16342 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 C11orf98-201ENST00000524958 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 INCENP-202ENST00000394818 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SNCA-204ENST00000394989 3167 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 STX3-207ENST00000633708 3111 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 REXO5-208ENST00000564274 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AKAP13-201ENST00000361243 9468 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 NAPEPLD-201ENST00000341533 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 VAMP7-202ENST00000286448 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 HTR5A-201ENST00000287907 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CCDC88C-204ENST00000389857 7474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TLE3-208ENST00000557907 2295 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DLL1-201ENST00000366756 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 GSTM3-201ENST00000256594 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC144450.1-201ENST00000366424 1641 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SPINT1-201ENST00000344051 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AL162431.2-201ENST00000358073 2424 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RAB6B-201ENST00000285208 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AL392046.1-202ENST00000457255 521 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CREBZF-204ENST00000527447 4037 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 RAB3D-201ENST00000222120 4273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 WASF3-202ENST00000361042 4823 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 UQCRB-201ENST00000287022 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 FAM122B-203ENST00000370790 4246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AMER1-202ENST00000374869 3688 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 GLP1R-201ENST00000373256 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CNTD1-204ENST00000588408 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 SEMA6D-202ENST00000354744 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PDCD2Q16342 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms