Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ZNF185-205ENST00000370270 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PCDHA2-202ENST00000520672 3056 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 GPA33-201ENST00000367868 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CT62-203ENST00000566432 2822 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 DIO1-216ENST00000613679 1856 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 NUTM2E-202ENST00000602967 3623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CSRNP2-201ENST00000228515 4471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ITFG1-204ENST00000544001 1849 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 EXOC3-201ENST00000315013 2682 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SH3BGRL3-202ENST00000319041 768 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RNA5SP412-201ENST00000516234 123 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 WLS-201ENST00000262348 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 FAM13B-203ENST00000425075 3098 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 PCDHB5-201ENST00000231134 3408 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ENOX1-201ENST00000261488 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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SIX1Q15475 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SIX1Q15475 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
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