Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CPSF1-212ENST00000616140 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GHET1-201ENST00000627071 1906 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCDHGA6-202ENST00000610583 5650 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PRKAB1-205ENST00000540121 1673 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MTHFSD-204ENST00000546093 2451 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC060814.4-201ENST00000594169 2163 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 COPS7B-203ENST00000373608 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TTC14-202ENST00000382584 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 IFT172-203ENST00000416524 1982 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 TRIT1-202ENST00000372818 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RIPOR1-204ENST00000428437 4152 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FURIN-206ENST00000610579 4191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
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HERC3Q15034 RCE1-204ENST00000525356 1270 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
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HERC3Q15034 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KLK11-207ENST00000594768 1347 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 HPS1-215ENST00000613394 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 MANBA-202ENST00000505239 2577 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
HERC3Q15034 CDCA3-202ENST00000422785 2760 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
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