Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 USP33-202ENST00000370792 2917 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SUMO4-201ENST00000326669 1066 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GSTT2-201ENST00000402588 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC006372.2-201ENST00000433660 292 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 S100A2-205ENST00000487430 752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NMNAT3-213ENST00000512391 794 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMEM123-208ENST00000532161 743 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 VENTXP3-201ENST00000546480 773 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC103808.3-201ENST00000579714 598 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GP6-203ENST00000417454 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMEM233-201ENST00000426426 3081 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TAGLN2-203ENST00000368097 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NCAM1-202ENST00000401611 2510 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UBE3A-228ENST00000638155 9131 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SGK1-220ENST00000524929 2594 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 DNAJC22-202ENST00000549441 4412 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 MRPS11-202ENST00000353598 766 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF614-202ENST00000356322 1293 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SPOCK3Q9BQ16 ZNF286A-201ENST00000395893 654 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
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