Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 DNAJC19-208ENST00000486355 828 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 ZNF706-209ENST00000520347 3502 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 TTYH3-204ENST00000407643 4537 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 DUOX2-201ENST00000389039 6533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 ATE1-208ENST00000540606 5165 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CAPZA3Q96KX2 TPO-202ENST00000345913 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 BRD1-201ENST00000216267 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SMPDL3B-206ENST00000549094 1611 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PCDHGB3-201ENST00000576222 4727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 COL1A1-201ENST00000225964 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 L3MBTL1-203ENST00000373135 3218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PPFIBP1-215ENST00000542629 3208 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AL008727.1-201ENST00000564460 4728 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 FGFRL1-202ENST00000398484 3639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PAX2-203ENST00000370296 4140 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PAX2-205ENST00000428433 4126 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 H1FX-AS1-201ENST00000383461 2600 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 KRT18P15-201ENST00000458108 1291 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 XYLT2-201ENST00000017003 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 ZNF239-205ENST00000535642 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SLC45A2-201ENST00000296589 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 TRPM5-201ENST00000155858 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 UBE2I-202ENST00000355803 3253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 RAB42-201ENST00000373826 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PLEKHA7-202ENST00000355661 4980 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 KANK4-201ENST00000317477 2080 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 MTMR2-201ENST00000346299 4681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 MTMR2-203ENST00000393223 4681 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 PER3-209ENST00000614998 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CAPZA3Q96KX2 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms