Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

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Length 305 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 KCNMA1-241ENST00000638606 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 KCNMA1-279ENST00000640182 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 LAIR1-204ENST00000391743 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 SEZ6-202ENST00000335960 4195 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 BNIP3L-201ENST00000380629 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CDC20B-202ENST00000322374 1679 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 TRIM40-207ENST00000396581 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 HMBOX1-203ENST00000397358 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
RNF148Q8N7C7 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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RNF148Q8N7C7 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
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