Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PELP1-202ENST00000436683 3524 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 OR2W2P-201ENST00000406313 909 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ROPN1L-AS1-201ENST00000513037 189 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MIR5091-201ENST00000578707 93 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC114488.2-208ENST00000591592 578 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC253536.1-201ENST00000437021 315 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AP001107.9-202ENST00000531602 613 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 FAM120C-201ENST00000328235 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LINC00882-204ENST00000484698 2718 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TINF2-215ENST00000626689 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RUBCN-202ENST00000296343 2919 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TIMM10-201ENST00000257245 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ABCD3-201ENST00000315713 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 RPLP1-202ENST00000357790 445 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 CMTM5-204ENST00000382809 378 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PILRB-213ENST00000609309 993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LINC01615-203ENST00000634877 673 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MEP1AP1-201ENST00000636082 1097 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 IL6RP1-201ENST00000417848 1273 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PXN-AS1-205ENST00000542314 707 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL355075.5-201ENST00000553568 890 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC109597.2-201ENST00000569407 927 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 Metazoa_SRP.64-201ENST00000611904 268 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ADH1B-207ENST00000639454 1210 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 METTL5-203ENST00000392640 800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TMCO1-203ENST00000464650 1100 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC090589.3-201ENST00000524412 574 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 TSPAN9-IT1-201ENST00000539784 562 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AC078923.1-201ENST00000552856 748 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL132780.2-203ENST00000555294 589 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AL390726.3-201ENST00000567428 635 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PTPN1-202ENST00000541713 3469 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PIK3R6-204ENST00000619866 3041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
USP34Q70CQ2 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
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