Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 MST1R-201ENST00000296474 4536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 DGCR2-201ENST00000263196 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 DGCR2-206ENST00000545799 4484 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC090386.2-201ENST00000623010 1039 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ACTN1-204ENST00000438964 3043 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 HPSE-201ENST00000311412 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 CACNA1G-226ENST00000513689 6879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 CACNA1G-228ENST00000514079 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 CACNA1G-231ENST00000515165 6870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SIGLEC12-201ENST00000291707 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 DTX2P1-UPK3BP1-PMS2P11-203ENST00000636308 4646 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SLC5A4-201ENST00000266086 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 OS9-203ENST00000389142 2457 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 PEX1-201ENST00000248633 4385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 EGR2-202ENST00000411732 2824 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 PITX2-211ENST00000613094 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF493-208ENST00000599461 1769 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 FBXO32-203ENST00000517956 6744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 HPX-201ENST00000265983 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 URGCP-201ENST00000336086 5658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 RPS27L-201ENST00000330964 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 MARK2-205ENST00000408948 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 NEU3-204ENST00000531509 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 BCAP29-201ENST00000005259 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 DNAJC14-202ENST00000317287 2774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 NHEJ1-201ENST00000356853 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
KLHL22Q53GT1 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms