Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 NOP58-201ENST00000264279 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC015909.5-201ENST00000624336 2266 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ELN-210ENST00000380584 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RN7SL81P-201ENST00000493781 261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AP002803.1-201ENST00000528836 498 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SIGLEC22P-201ENST00000599104 714 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SIGLEC22P-202ENST00000602065 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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CCDC142Q17RM4 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 C1orf232-202ENST00000635463 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CLPB-209ENST00000538039 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 VWCE-202ENST00000335613 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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