Protein–RNA interactions for Protein: P61578

ERVK-16, Endogenous retrovirus group K member 16 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-16P61578 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MYO7A-201ENST00000409619 7106 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PANK3-201ENST00000239231 10506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 OTOF-203ENST00000339598 4756 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 USH1C-201ENST00000005226 2700 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 FRMD6-203ENST00000395718 4828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MROH7-TTC4-201ENST00000414150 5867 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 FAM225B-201ENST00000423546 5629 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 FLNA-202ENST00000360319 8281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 METAP1D-201ENST00000315796 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 DGCR9-201ENST00000609630 2415 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CSF2RB-203ENST00000406230 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 USP33-203ENST00000370793 4502 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 E2F3P2-201ENST00000447755 1422 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC234782.2-201ENST00000614615 1240 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 DLK1-201ENST00000331224 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 IGHG4-202ENST00000641978 2597 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 GDPD5-201ENST00000336898 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CBL-201ENST00000264033 11231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 RNF24-201ENST00000336095 7453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
ERVK-16P61578 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms