Protein–RNA interactions for Protein: P53539

FOSB, Protein fosB, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOSBP53539 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 PHLDB2-204ENST00000431670 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 OCRL-201ENST00000357121 5138 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 TACC3-212ENST00000612220 1756 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 TBC1D24-201ENST00000293970 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 AL132709.1-203ENST00000555103 569 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 SPHK2-206ENST00000598088 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
FOSBP53539 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CCDC86-201ENST00000227520 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 WWTR1-203ENST00000465804 5030 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC092171.2-201ENST00000444210 3251 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TNS2-203ENST00000379902 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AL139193.2-201ENST00000553712 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 EIF4G1-219ENST00000435046 4668 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ACADM-218ENST00000541113 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MYL10-201ENST00000223167 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC140658.4-201ENST00000561990 352 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 DHX30-201ENST00000348968 3994 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 WDFY1-201ENST00000233055 4660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RTL5-202ENST00000609883 4105 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
FOSBP53539 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.7 ms