Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 AC073869.4-201ENST00000620841 800 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
TNNI2P48788 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TNNI2-201ENST00000252898 678 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RPRD2-201ENST00000369067 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TNNI2-202ENST00000381905 706 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TNNI2-203ENST00000381906 745 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TNNI2-204ENST00000381911 743 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RBM4-203ENST00000398692 921 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RBM4-207ENST00000506523 654 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 PAX5-210ENST00000520281 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TRMT10B-202ENST00000377753 2027 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 METTL6-202ENST00000383790 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 MORN2-201ENST00000340556 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 FKBP1B-205ENST00000452109 953 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 TMEM222-204ENST00000466759 368 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
TNNI2P48788 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms