Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 REV1-202ENST00000393445 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LDB3-204ENST00000372066 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AP001999.1-201ENST00000513405 3684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GUSBP11-206ENST00000455485 3816 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CD1E-206ENST00000368161 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SPECC1L-ADORA2A-201ENST00000358654 6204 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RGS3-205ENST00000374134 2862 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TLE3-211ENST00000557997 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NCF2-201ENST00000367535 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PCDHA5-203ENST00000614258 4248 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TJAP1-208ENST00000438588 2716 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CDH3-201ENST00000264012 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AL136295.7-201ENST00000619226 1200 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ATXN2L-215ENST00000564304 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MPRIP-202ENST00000341712 3846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 STXBP6-202ENST00000396700 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TTC38-201ENST00000381031 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SPATA12-201ENST00000334325 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 PGAP2-203ENST00000396986 1837 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HNRNPDL-207ENST00000614627 3968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 HFE-201ENST00000309234 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms