Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZNF556-202ENST00000586426 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HK2-201ENST00000290573 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LCOR-203ENST00000371097 4852 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PFAS-201ENST00000314666 5371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SRA1-201ENST00000336283 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ANKRD30B-202ENST00000358984 4359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 KDM5C-208ENST00000452825 6096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PMFBP1-208ENST00000537792 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DAZL-201ENST00000250863 3104 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ABCA17P-202ENST00000469908 4188 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CNTN2-201ENST00000331830 7999 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SVOPL-202ENST00000419765 1523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DCUN1D4-201ENST00000334635 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ABCD1P2-201ENST00000429313 1601 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms