Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 RNA5SP407-201ENST00000410275 110 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 TXN2-204ENST00000416967 1280 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC092100.1-201ENST00000435148 702 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC079944.2-201ENST00000478867 734 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 LINC02130-201ENST00000566054 518 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 TRIM60-201ENST00000341062 1867 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 MRPL55-213ENST00000366740 644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 APRT-202ENST00000426324 664 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 NDFIP2-AS1-201ENST00000457171 431 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 NUP210P2-201ENST00000510577 282 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 AP003108.1-201ENST00000534856 554 ntTSL 4 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLC7A8-214ENST00000621729 1371 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 RCBTB2-206ENST00000544904 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 AP000787.1-205ENST00000536683 1485 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 WISP1-205ENST00000519433 545 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 HIST1H4K-201ENST00000611927 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 MIR7848-201ENST00000617402 101 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 ADAM17-203ENST00000497134 1873 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
DMDP11532 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AP000487.2-201ENST00000324630 394 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 SNORD88B-201ENST00000408454 91 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL136360.2-201ENST00000502636 581 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 IL32-230ENST00000551122 733 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL589743.3-201ENST00000604121 517 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC010325.1-203ENST00000636757 380 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 TNNT2-201ENST00000236918 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL512288.1-201ENST00000448015 491 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 SPATA24-204ENST00000507779 606 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 ALG1L14P-201ENST00000514230 434 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 SLC25A5P6-201ENST00000515328 886 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC025682.1-203ENST00000584391 442 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC012313.2-201ENST00000599952 1154 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 MIR941-1-201ENST00000636396 72 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 ZSCAN29-207ENST00000568898 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 WRB-202ENST00000380708 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 MFSD2B-201ENST00000338315 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 AC020741.1-201ENST00000381217 2079 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 SSR4P1-201ENST00000415143 412 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 EEF1GP3-201ENST00000421044 1288 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 CHN2-214ENST00000439711 755 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 COPZ1-206ENST00000549043 1232 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 MIR4526-201ENST00000583168 87 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 GH2-205ENST00000622506 702 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
DMDP11532 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
DMDP11532 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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