Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01002-209ENST00000631858 1761 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HCN3-201ENST00000368358 3718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNRC6C-211ENST00000636222 7093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PCDHGB8P-202ENST00000507007 2873 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARSG-201ENST00000448504 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC11-202ENST00000377577 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRXN1-233ENST00000630543 4500 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMBRA1-212ENST00000534300 5067 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZKSCAN1-202ENST00000426572 2011 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CDH1-212ENST00000611625 4878 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008758.4-201ENST00000435033 2593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMA4-207ENST00000424408 5983 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPRN2-202ENST00000389416 4692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCA2-254ENST00000636903 2471 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC5A11-205ENST00000545376 2294 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP2A3-203ENST00000359983 3290 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NFXL1-202ENST00000381538 3728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-206ENST00000393256 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGEF3-213ENST00000496106 1994 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FMNL1-202ENST00000331495 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SGSM1-201ENST00000400358 6643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CACNA1C-219ENST00000399649 6529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC9-201ENST00000372950 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BCL2L11-223ENST00000622612 4995 ntTSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TGFBRAP1-203ENST00000595531 5595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPX2-202ENST00000340513 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC1-202ENST00000458464 2849 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHM1-201ENST00000430334 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDXK-201ENST00000291565 7366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RALGAPB-201ENST00000262879 8663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP1A1-201ENST00000295598 3654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNRNP48-201ENST00000342415 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VWA8-203ENST00000379310 7147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HYPK-201ENST00000406925 4777 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF568-201ENST00000333987 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZFC3H1-201ENST00000378743 7285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FLCN-201ENST00000285071 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PYGL-206ENST00000544180 2696 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TREH-202ENST00000397925 1718 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023355.1-202ENST00000612262 4242 ntTSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL162231.4-201ENST00000564224 3264 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 INHBC-201ENST00000309668 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RTFDC1-202ENST00000357348 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCR3-204ENST00000376073 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
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