Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 HIST1H2BK-201ENST00000356950 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 COPS7B-204ENST00000409091 806 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 AL512622.1-202ENST00000443922 478 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 CU639417.1-201ENST00000464664 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 H2BFS-201ENST00000599962 460 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 AL136982.5-201ENST00000605222 294 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 DEDD-202ENST00000368006 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 EML4-203ENST00000402711 3568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 POLR2G-201ENST00000301788 827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 AL451105.2-201ENST00000413763 1234 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 DLEU2-205ENST00000443587 705 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 GH2-203ENST00000449787 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 MBP-238ENST00000580402 915 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 AC126755.5-201ENST00000622756 267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 LINC01869-204ENST00000635639 1047 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 AC139713.2-207ENST00000641556 1292 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 AC239800.3-201ENST00000424684 5243 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
F8W031 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8W031 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8W031 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8W031 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8W031 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8W031 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8W031 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
F8W031 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms