Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBT6

POLK, DNA polymerase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLKQ9UBT6 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MKRN2-202ENST00000411987 1436 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CDK20-201ENST00000325303 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC072061.1-201ENST00000569710 2234 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ATP5A1-215ENST00000590665 1793 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 GEMIN8P4-201ENST00000380526 729 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CACNG7-202ENST00000391766 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ELFN1-AS1-201ENST00000415399 636 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RPL15-205ENST00000415719 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC011474.4-201ENST00000623523 2076 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CNMD-203ENST00000448904 1444 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL080243.1-201ENST00000423293 1060 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL512599.1-201ENST00000430724 685 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 FSTL4-207ENST00000621681 2660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 OR6F1-204ENST00000641470 1762 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
POLKQ9UBT6 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms