Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 EMILIN1-201ENST00000380320 3943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AGAP12P-201ENST00000585227 2359 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CCDC88C-201ENST00000331194 3104 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PRR29-202ENST00000412177 3127 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PSAP-202ENST00000394936 2872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CHMP7-201ENST00000313219 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 KIFC3-211ENST00000562903 3221 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ACIN1-201ENST00000262710 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PLA2G4B-201ENST00000452633 2985 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RXRG-204ENST00000619224 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CCND3-215ENST00000511642 2394 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 GRIN1-202ENST00000371546 4114 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ABCB6Q9NP58 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCB6Q9NP58 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCB6Q9NP58 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCB6Q9NP58 ADGRA1-201ENST00000392606 3438 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ABCB6Q9NP58 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.4 ms