Protein–RNA interactions for Protein: Q99698

LYST, Lysosomal-trafficking regulator, humanhuman

Predictions only

Length 3,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYSTQ99698 AL359915.2-202ENST00000440150 2469 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 KRT8P25-201ENST00000473150 1456 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ASMT-203ENST00000381241 1388 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 L3MBTL1-204ENST00000418998 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MAPKAP1-204ENST00000373498 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 METTL22-203ENST00000561758 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 NLK-203ENST00000582037 1503 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PRAME-214ENST00000543184 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 APOO-201ENST00000379226 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 LINC01494-201ENST00000419511 1011 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AL356289.1-203ENST00000439795 789 ntTSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CTNNBL1-203ENST00000373473 1493 ntTSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 OR52N1-201ENST00000317078 963 ntAPPRIS P1 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC012100.1-201ENST00000470304 282 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RN7SL322P-201ENST00000583519 299 ntBASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TRIQK-219ENST00000523580 1630 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.33□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 HAO1-201ENST00000378789 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MIR4435-2HG-201ENST00000308604 552 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC079250.1-201ENST00000456046 531 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC090200.1-201ENST00000522918 590 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC007336.3-201ENST00000623886 2160 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PHBP3-201ENST00000412562 819 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 C5orf38-203ENST00000457752 387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 GOLT1B-206ENST00000542038 933 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC025265.3-201ENST00000550175 468 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 COX14-204ENST00000550654 580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RN7SL5P-201ENST00000581458 321 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MIR6074-201ENST00000612054 107 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 BNIP1-202ENST00000351486 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC069421.1-201ENST00000447462 323 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 AC022784.6-203ENST00000520255 863 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RAB11B-205ENST00000601897 577 ntTSL 3 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 LINC02498-201ENST00000635390 1065 ntTSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SNHG28-201ENST00000368102 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 DDO-202ENST00000368924 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC9.32□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC9.31□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
LYSTQ99698 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.31□□□□□ -0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms