Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AL160290.2-202ENST00000448671 574 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 KRT8P1-201ENST00000557533 1207 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FHOD3-206ENST00000590592 4869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TGM2-201ENST00000361475 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGEF33-202ENST00000409978 4484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 C10orf88-204ENST00000481909 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LBH-201ENST00000395323 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NCKIPSD-204ENST00000416649 2925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 ZHX1-202ENST00000395571 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 DUT-208ENST00000559540 1441 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 BMF-201ENST00000354670 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 UHMK1-203ENST00000538489 8446 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 NOX5-201ENST00000260364 8592 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
CDK5RAP3Q96JB5 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TCF3-201ENST00000262965 4451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DIS3L2-205ENST00000409401 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CAPN5-201ENST00000278559 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NTN4-201ENST00000343702 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CDK5RAP3Q96JB5 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms