Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

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Length 1,022 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 PCBD1-201ENST00000299299 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC022080.1-201ENST00000366255 781 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AL353658.1-201ENST00000436263 789 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM138B-202ENST00000446648 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM138C-202ENST00000449442 1126 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 AC074389.3-201ENST00000450458 454 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 OVOL3-201ENST00000585332 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FAM138F-201ENST00000631376 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CERCAM-214ENST00000613052 1429 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
HERC6Q8IVU3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TPM3-205ENST00000328159 1771 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 DMTN-207ENST00000517305 2551 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CDCA4P4-201ENST00000435216 680 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RPAIN-205ENST00000536255 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 MT3-202ENST00000561640 514 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 URAHP-205ENST00000610227 398 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RTFDC1-203ENST00000395881 1572 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NCKAP5L-201ENST00000335999 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ARHGEF26-AS1-204ENST00000491862 2598 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 B3GNTL1-201ENST00000320865 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 IMMT-212ENST00000620815 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 KRTAP6-1-201ENST00000329122 500 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
HERC6Q8IVU3 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
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