Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 EHMT2-201ENST00000375528 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 HOXC4-202ENST00000430889 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AATBC-203ENST00000448247 1889 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ADPRH-205ENST00000478927 1501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SERPINH1-205ENST00000525876 2283 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 OR2I1P-208ENST00000641137 4948 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FLNA-201ENST00000344736 7932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF772-204ENST00000427512 5130 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 C19orf57-204ENST00000586783 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MKS1-201ENST00000313863 2091 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 TMEM121B-202ENST00000399875 3961 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MATN1-AS1-201ENST00000414532 3925 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SCN8A-202ENST00000355133 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MYNN-201ENST00000349841 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 RCAN2-204ENST00000405162 2457 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 GNAI2-203ENST00000422163 2407 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 COL6A2-203ENST00000397763 3101 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 PDE1C-205ENST00000396191 2952 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 MTMR4-204ENST00000579925 5622 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 SPG11-202ENST00000427534 6935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CHMP7-202ENST00000397677 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TDRD12Q587J7 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms