Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CCDC142Q17RM4 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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CCDC142Q17RM4 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 CCDC88A-201ENST00000263630 9667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CCDC142Q17RM4 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.02
CCDC142Q17RM4 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
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