Protein–RNA interactions for Protein: Q13670

PMS2P11, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P11Q13670 MAMDC4-201ENST00000317446 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC110048.1-201ENST00000604293 2157 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NDRG4-236ENST00000566192 3265 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NOS3-201ENST00000297494 4388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ZNF410-201ENST00000324593 2293 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CIT-219ENST00000612548 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MEP1A-201ENST00000230588 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MYO9B-206ENST00000595618 7623 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 MYT1-201ENST00000328439 5535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SECISBP2-201ENST00000339901 3320 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FAM200A-202ENST00000449309 2480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NEDD4L-208ENST00000456173 4978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 NTM-206ENST00000427481 2583 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 OPN4-201ENST00000241891 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 TBC1D3P2-203ENST00000581291 2088 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 EIF4G1-207ENST00000411531 4683 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC002350.2-201ENST00000623894 1828 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 SLC5A8-201ENST00000536262 4178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 TRMT61A-202ENST00000389749 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 C3orf20-202ENST00000412910 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
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PMS2P11Q13670 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PAPLN-203ENST00000554301 4090 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC036108.2-201ENST00000566974 2562 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 INPP5E-201ENST00000371712 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FLAD1-207ENST00000368433 2656 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RPS6KC1-209ENST00000615329 4022 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PDGFRB-201ENST00000261799 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 CACNA1G-219ENST00000507609 6849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GATC-203ENST00000551765 4244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC021218.1-201ENST00000377722 2536 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SPAG8-202ENST00000396638 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DPAGT1-217ENST00000639704 1719 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 BCRP2-203ENST00000461808 1832 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PMS2P11Q13670 ILF3-201ENST00000250241 3035 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
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