Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AKR1C2-202ENST00000421196 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 IKBKE-201ENST00000578328 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DAXX-213ENST00000620164 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CDC14B-201ENST00000375240 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RAB37-204ENST00000392613 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KCNS2-202ENST00000521839 4340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC108002.1-201ENST00000520572 5684 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 VILL-201ENST00000283713 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 FCHO1-221ENST00000597512 2934 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TJAP1-204ENST00000372449 2695 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 CHRFAM7A-201ENST00000299847 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 FAM96A-203ENST00000557835 1536 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TICRR-201ENST00000268138 6775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MORC4-202ENST00000355610 3834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HTR4-203ENST00000377888 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MDM1-201ENST00000303145 2918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 PPP1R26P2-201ENST00000611403 3595 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 HECTD1-219ENST00000611816 8980 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 INO80-202ENST00000401393 5991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ABI2-201ENST00000261016 6634 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ABI2-203ENST00000261018 6638 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 FOXN4-202ENST00000355216 2958 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DAO-201ENST00000228476 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 VENTXP1-201ENST00000569334 2716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SAP30BP-225ENST00000584667 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 RABGEF1-210ENST00000437078 4319 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 TMEM57-201ENST00000374343 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
UBASH3AP57075 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms