Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 RN7SL67P-201ENST00000492147 296 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 FGFR3P5-201ENST00000564496 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ACAD8-201ENST00000281182 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PLCXD2-201ENST00000393934 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TMEM14C-205ENST00000541412 1177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC135983.1-201ENST00000562108 1097 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL021707.6-201ENST00000609212 491 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 C9orf152-201ENST00000400613 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PRF1-202ENST00000441259 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SPOCK3-218ENST00000511531 2908 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 TLE1-203ENST00000376499 3893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SMTNP53814 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SMTNP53814 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms