Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FAM224B-201ENST00000458667 2032 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ARMC7-201ENST00000245543 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL445250.1-201ENST00000641671 2259 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MSH5-202ENST00000375740 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DYNC1I1-202ENST00000359388 2843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CLASP2-204ENST00000399362 7282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TMEM130-201ENST00000339375 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FCHSD1-209ENST00000522783 2477 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC01229-201ENST00000561510 1494 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PPCDC-205ENST00000563393 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PPCDC-208ENST00000567336 892 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 OPRL1-203ENST00000355631 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PRMT3-202ENST00000331079 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 XRRA1-207ENST00000527087 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CASP4P49662 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MORN4-201ENST00000307450 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 WDR17-205ENST00000508596 4294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 KIZ-213ENST00000620891 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MRPL17-201ENST00000288937 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ALKBH2-203ENST00000440112 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CASP4P49662 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms