Protein–RNA interactions for Protein: P48651

PTDSS1, Phosphatidylserine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTDSS1P48651 EDEM3-202ENST00000367512 6678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TRIM11-204ENST00000493030 5774 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 HYOU1-221ENST00000621959 3358 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CELSR1-201ENST00000262738 11389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MFSD11-201ENST00000336509 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ZSCAN32-202ENST00000396846 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ZSCAN32-203ENST00000396852 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 QRICH1-204ENST00000424300 3009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 WDR6-201ENST00000395474 4401 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SLC8B1-202ENST00000546737 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AL583810.2-201ENST00000556430 3254 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CYP4F11-201ENST00000248041 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DENND1C-201ENST00000381480 2816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 GAS7-219ENST00000585266 3535 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 OPRL1-202ENST00000349451 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ETAA1-201ENST00000272342 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 VPS33B-202ENST00000535906 2420 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 NBAT1-201ENST00000566912 1940 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SELPLG-203ENST00000550948 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 UBA3-201ENST00000349511 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 DDX50-201ENST00000373585 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SEC31A-208ENST00000448323 4255 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SLC13A2-201ENST00000314669 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MDH2-204ENST00000443006 2020 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 CRHR2-201ENST00000341843 3131 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 MDH2-203ENST00000432020 1548 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PRTFDC1-201ENST00000320152 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PNMA5-203ENST00000439251 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 PARP3-201ENST00000398755 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
PTDSS1P48651 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 NAPB-207ENST00000617876 3883 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 FAM237B-201ENST00000637645 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ERN2-201ENST00000256797 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 AL590644.1-201ENST00000412427 4676 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 PCDHB2-201ENST00000194155 4126 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
PTDSS1P48651 KCNH1-202ENST00000367007 3445 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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