Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ANO3-205ENST00000531646 1264 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SHBG-210ENST00000572262 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 DDR1-225ENST00000376568 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GOPC-201ENST00000052569 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MC5R-201ENST00000324750 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SLC39A11-202ENST00000542342 2752 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ACTN1-205ENST00000538545 2813 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 UPK1A-201ENST00000222275 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC025186.1-201ENST00000478174 870 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SCAF11-203ENST00000395453 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TRAF1-201ENST00000373887 6324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ENDOV-207ENST00000518907 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RGR-203ENST00000372092 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 KRTAP10-5-201ENST00000400372 1150 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AP003068.3-201ENST00000527789 175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RANGAP1P46060 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms