Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 PER3-201ENST00000361923 6203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC141928.1-201ENST00000511928 4525 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 NCOR2-204ENST00000405201 8533 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 DLX1-203ENST00000361725 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 LRRC32-201ENST00000260061 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
USP8P40818 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 PCGF2-202ENST00000611883 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 C6orf62-202ENST00000378119 4134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 PEAR1-202ENST00000338302 4970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 ADGRD1-201ENST00000261654 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 LAMA4-209ENST00000453937 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 NAA40-206ENST00000542163 1035 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 HIST2H2BF-201ENST00000369167 1954 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 TBC1D8-AS1-201ENST00000610202 2478 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 NDUFA10-201ENST00000252711 4915 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 BAG2-201ENST00000370693 6651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 HMGA1-203ENST00000374116 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
USP8P40818 TRPM2-201ENST00000300481 5627 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 PDE8B-205ENST00000346042 3276 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 TUNAR-201ENST00000503525 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 NEK9-201ENST00000238616 8310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
USP8P40818 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms