Protein–RNA interactions for Protein: P35606

COPB2, Coatomer subunit beta', humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPB2P35606 SEPT7-AS1-201ENST00000412856 587 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ASS1P2-201ENST00000439895 1223 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ALG1L3P-201ENST00000503331 765 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC005323.2-202ENST00000581304 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 C19orf70-203ENST00000587589 577 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 UXT-AS1-202ENST00000591832 565 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL031673.1-201ENST00000611460 466 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC092053.3-201ENST00000641308 4975 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GABPA-202ENST00000400075 4814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NTF3-202ENST00000423158 1336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 OR2K2-201ENST00000302681 1078 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NDUFB6-202ENST00000366466 761 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SURF4-203ENST00000371991 715 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 UPK1A-202ENST00000379013 1016 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 KRT18P37-201ENST00000520711 1282 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 Metazoa_SRP.157-201ENST00000622819 262 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CT55-201ENST00000276241 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 AL109809.1-201ENST00000418979 1367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
COPB2P35606 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms