Protein–RNA interactions for Protein: P17861

XBP1, X-box-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XBP1P17861 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 Metazoa_SRP.166-201ENST00000612530 253 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
XBP1P17861 CACNA1I-202ENST00000402142 10004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NCLP1-201ENST00000445357 1963 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PSME4-202ENST00000404125 7099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC00865-202ENST00000448963 4272 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DDX54-202ENST00000314045 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 WDFY2-203ENST00000612477 6932 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RPS6KA2-AS1-201ENST00000455390 627 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SLC25A15P3-201ENST00000505530 290 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 CNTLN-201ENST00000380641 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PRR26-202ENST00000441152 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
XBP1P17861 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.7 ms