Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 RPS7-202ENST00000403564 764 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC053503.4-201ENST00000431827 224 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AADAC-202ENST00000488869 719 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 VEGFA-224ENST00000523873 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CYP2B7P-202ENST00000593298 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC138430.2-201ENST00000624068 504 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC093495.1-215ENST00000626655 821 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 LINC00959-202ENST00000637128 826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CACNB4-201ENST00000201943 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AGPAT1-203ENST00000375107 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CYP2B7P-201ENST00000541697 1476 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CREB3L4-203ENST00000368601 950 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 KHDC1L-201ENST00000370388 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CD74-203ENST00000377795 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 SNAP25-AS1-202ENST00000426491 804 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 GPHB5-202ENST00000621500 543 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ZNF397-209ENST00000591206 1516 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 GPATCH2L-202ENST00000312858 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 GTF2F2-201ENST00000340473 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TUBB8P5-201ENST00000445286 1351 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 KRTAP10-10-201ENST00000380095 1100 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 HIST1H2BN-201ENST00000396980 432 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC234582.2-201ENST00000455788 568 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 RASGRF2-AS1-202ENST00000505694 535 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 RPS23-205ENST00000510019 1019 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 POU5F1-207ENST00000606567 1236 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 IFI27-214ENST00000620396 599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 LINC00643-207ENST00000637212 734 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 FAM183BP-201ENST00000409072 1595 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CFTRP13569 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TSC22D3-204ENST00000372384 2199 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ZNF582-201ENST00000301310 2824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 MRPL43-202ENST00000318325 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TLN2-202ENST00000472902 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 FMR1-218ENST00000621447 1832 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CDC20P1-201ENST00000488829 1500 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TEPP-201ENST00000290871 1079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 GZMH-202ENST00000382548 687 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC105446.1-201ENST00000441882 407 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AL357140.1-201ENST00000454104 424 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 DIS3L2P1-201ENST00000509197 559 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AP001922.5-201ENST00000527803 651 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 C14orf132-201ENST00000553764 562 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 IGHV1OR16-3-201ENST00000568138 205 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC103810.4-201ENST00000578601 257 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 AC131274.3-201ENST00000578745 1271 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ZNF268-219ENST00000611984 583 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 LILRA5-201ENST00000432233 1363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TUBB8-207ENST00000568866 1367 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CFTRP13569 DCAF13-201ENST00000297579 2642 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CFTRP13569 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms