Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 REG3G-202ENST00000393897 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SNORA47-201ENST00000458862 138 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AIPL1-210ENST00000576307 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 COASY-211ENST00000590958 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HDAC7-209ENST00000427332 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SIGLEC6-204ENST00000391797 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AADACL4-201ENST00000376221 1575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HAX1-201ENST00000328703 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SL162P-201ENST00000579233 292 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 Metazoa_SRP.63-201ENST00000617144 298 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CPSF4L-202ENST00000397671 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL359092.2-201ENST00000423330 585 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC023141.7-201ENST00000430646 407 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PRR34-AS1-203ENST00000451166 877 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ACY3-202ENST00000529256 933 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ERVV-2B6SEH9 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 AC152010.1-201ENST00000415779 2006 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ERVV-2B6SEH9 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms