Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXD2

SCG3, Secretogranin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 468 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCG3Q8WXD2 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FAM155B-201ENST00000252338 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SLC1A1-201ENST00000262352 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CTR9-201ENST00000361367 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 OS9-218ENST00000551035 2246 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CYP4F3-201ENST00000221307 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 NAA60-203ENST00000414063 2619 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DDC-AS1-201ENST00000454521 1776 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KANK2-205ENST00000589359 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 KIAA1614-201ENST00000367587 3309 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IFITM10-201ENST00000340134 3706 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MIR193BHG-211ENST00000641433 5365 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 GABPB1-201ENST00000220429 2726 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SLC29A4-203ENST00000406453 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CX3CL1-204ENST00000565912 5796 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 COL6A1-201ENST00000361866 4238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TKFC-201ENST00000394900 4696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 BMP4-206ENST00000559087 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC068075.1-201ENST00000519714 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 OS9-206ENST00000435406 2346 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SPRY1-208ENST00000622283 2352 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 AC004899.2-201ENST00000622993 3860 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 ACOX1-201ENST00000293217 7514 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SCG3Q8WXD2 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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