Protein–RNA interactions for Protein: P55084

HADHB, Trifunctional enzyme subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HADHBP55084 NADK-202ENST00000341991 3098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZNF277-201ENST00000361822 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CICP9-201ENST00000444451 1913 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MEAF6-204ENST00000373075 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RCC2P5-201ENST00000492126 1487 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GJB5-201ENST00000338513 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AL713999.1-201ENST00000473363 753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RCN1-210ENST00000532942 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC104982.3-201ENST00000581995 514 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SMIM11B-202ENST00000619874 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 C1S-202ENST00000360817 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 FFAR4-202ENST00000371483 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 NSF-201ENST00000398238 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RC3H2-201ENST00000335387 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 BX255923.2-202ENST00000620833 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LSM14A-201ENST00000433627 3424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 METTL12-203ENST00000532971 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CAPN14-202ENST00000403897 2197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SERPINF1-201ENST00000254722 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 NR1H3-201ENST00000395397 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 GABRR2-201ENST00000402938 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 AL355336.1-201ENST00000451355 1676 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
HADHBP55084 NEK3-205ENST00000610828 2396 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms