Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LINC01922-202ENST00000567168 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC064850.1-201ENST00000413279 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 YWHAQ-201ENST00000238081 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC020931.1-201ENST00000589622 1346 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC020763.3-201ENST00000625095 2904 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CDRT15L2-201ENST00000399044 1048 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PHBP10-201ENST00000416467 784 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CORO1C-203ENST00000421578 1296 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 JAZF1-AS1-201ENST00000436758 548 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CITED1-209ENST00000453707 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC078852.1-201ENST00000515842 441 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MIR4746-201ENST00000579802 71 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PARP3-203ENST00000431474 2360 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ETNPPL-202ENST00000411864 2028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SHISA5-206ENST00000426002 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ABLIM2-215ENST00000545242 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 RNF121-211ENST00000530137 2202 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC007491.1-201ENST00000637560 1306 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MAGEC3-205ENST00000544766 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ZNRF4-201ENST00000222033 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CD37-203ENST00000426897 1204 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC010086.2-201ENST00000428616 226 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 LINC00399-201ENST00000439008 414 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC019118.1-201ENST00000454530 435 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 CRABP2-204ENST00000621784 1033 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AP2M1-207ENST00000439647 1950 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXD8P13378 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms