Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 RPL18A-203ENST00000599870 1084 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 STAG3L1-204ENST00000619870 1192 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ESR1-214ENST00000638569 132 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC005912.2-201ENST00000619492 2400 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PRL-201ENST00000306482 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 POLR1C-203ENST00000372389 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 C11orf53-201ENST00000280325 1208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 S100A13-203ENST00000392623 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RPL10-203ENST00000406022 748 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC012506.1-201ENST00000423706 525 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC041040.1-201ENST00000425197 460 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01523-201ENST00000425385 450 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CASP3-205ENST00000517513 964 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC073569.2-201ENST00000551995 354 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 HIST2H4A-201ENST00000578186 583 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 Metazoa_SRP.200-201ENST00000622073 282 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MARVELD2-203ENST00000436532 1563 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ART3-201ENST00000341029 1517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SFMBT2-202ENST00000379711 692 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CALCA-205ENST00000486207 851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC083801.1-201ENST00000491689 358 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 FAM86KP-201ENST00000509817 987 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 AC009779.3-204ENST00000549424 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RNF103-CHMP3-202ENST00000604011 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CSTP2-201ENST00000610599 398 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
SMIM10L2BP0DMW5 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms