Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 UBIAD1-201ENST00000376804 825 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SAA2-206ENST00000530400 323 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC009812.1-201ENST00000605948 1059 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL353581.1-201ENST00000606916 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CYP2B6-202ENST00000593831 1426 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PIGB-202ENST00000539642 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SMUG1-220ENST00000513838 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LINC00682-202ENST00000499082 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RNA5SP84-201ENST00000364740 107 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PMF1-201ENST00000368273 884 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AP001331.1-201ENST00000413008 1015 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC096536.3-201ENST00000415336 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 HDHD5-AS1-202ENST00000431923 616 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RN7SL33P-201ENST00000462543 342 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL139099.3-201ENST00000556657 401 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PEX11A-204ENST00000561224 529 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC142381.4-201ENST00000566806 702 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC142086.5-201ENST00000567619 702 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC112220.4-201ENST00000604982 1263 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC012594.1-273ENST00000626618 816 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 KRT26-201ENST00000335552 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AP000437.1-201ENST00000624057 2085 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC015813.5-201ENST00000624641 1514 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GOLGA8N-205ENST00000569659 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 HLA-DQA1-201ENST00000343139 1591 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FAM157C-201ENST00000563357 1806 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TCEAL5-201ENST00000372680 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MRPL48-203ENST00000398483 1058 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SNORD23-201ENST00000408876 110 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TISP43-202ENST00000409982 1039 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC246787.2-202ENST00000418566 370 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 RBMX2P5-201ENST00000424312 969 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC108879.1-201ENST00000438026 828 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL355500.1-201ENST00000439421 297 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL662899.2-201ENST00000503322 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC026150.1-201ENST00000562992 701 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC005332.2-201ENST00000590010 930 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC136475.1-203ENST00000602756 1034 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL078624.1-201ENST00000604004 547 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL031768.1-201ENST00000606542 701 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MDC1-209ENST00000613547 830 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 LARP4-207ENST00000518561 1578 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DCDC2B-201ENST00000409358 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 ZMAT5-201ENST00000344318 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MUC1-207ENST00000368392 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MUC1-208ENST00000368393 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 NUDT2-203ENST00000379158 1075 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 IGSF23-201ENST00000402988 989 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC091729.3-203ENST00000413706 674 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AL162151.1-201ENST00000423922 561 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 AC105443.1-201ENST00000433754 712 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
C4BP0C0L5 MUC1-213ENST00000462215 1189 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
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