Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 APTX-211ENST00000463596 1345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 NEAT1-201ENST00000499732 1811 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 CDCA3-207ENST00000538862 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 CST5-201ENST00000304710 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC018463.1-201ENST00000456674 917 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 LRSAM1-203ENST00000373322 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC145207.1-201ENST00000415556 691 ntTSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SLC5A4-AS1-201ENST00000434942 876 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 KIAA0895-203ENST00000338533 4132 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 ZIK1-201ENST00000307468 2510 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
LPIN3Q9BQK8 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms