Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYB3

FOXD4L6, Forkhead box protein D4-like 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L6Q3SYB3 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TBC1D9B-208ENST00000519746 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TRPM5-202ENST00000528453 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL121827.1-201ENST00000370257 3264 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MTMR11-201ENST00000369140 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ABL2-207ENST00000507173 3177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf18-201ENST00000314391 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PKIG-201ENST00000349959 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC099684.2-201ENST00000574520 870 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 KY-202ENST00000503669 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC187-204ENST00000624277 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SCOC-210ENST00000608372 5129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NCDN-201ENST00000356090 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NF1-204ENST00000431387 2889 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ANKRD36-204ENST00000461153 6102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SF3A1-201ENST00000215793 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ELN-211ENST00000414324 3139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 C16orf62-215ENST00000542263 3138 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CCT8L1P-201ENST00000465400 1674 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 APCDD1L-AS1-203ENST00000427140 2092 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 FAM71E2-201ENST00000424985 3191 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 BCCIP-202ENST00000299130 2337 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PRDM16-208ENST00000514189 4236 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 MIR34AHG-203ENST00000635687 4211 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 LRRC41-208ENST00000617760 2158 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 SLC9A8-201ENST00000361573 6094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 CACNA2D2-204ENST00000424201 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FOXD4L6Q3SYB3 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms